Além da degradação dos solos o desmatamento promove a destruição de fauna e flora nativas da região desmatada, com isso a cadeia alimentar do ambiente sofre mudanças radicais e até mesmo problemas de superpopulação e posteriormente surgem as pragas.
Outro efeito desse desmatamento é a redução da biodiversidade, além disso pode ocorrer o desmatamento das matas ciliares, que protegem varias zonas de inundações. As queimadas também representam um ´serio problema para a natureza.